دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران جنوب

صفحه اصلی / اولین کنفرانس ملی شیمی، نانو مواد، پلیمر- چالش ها و کاربردها

مدلسازی رابطه کمی ساختار- ویژگی به منظورپیش بینی خواص ترمودینامیکی مولکول های کوچک متصل به ساختار RNA

نویسندگان :

حمیده حمزه علی¹ شهین احمدی²

1- دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شرق 2- دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم پزشکی تهران

کلمات کلیدی :

خواص ترمودینامیکی،روش مونت کارلو،ساختارRNA،QSPR،نرم افزار کورال

چکیده :

تنوع عناصر ساختاری RNA در بیماری های انسانی، RNA را به یک درمان جذاب تبدیل می کند [1]. با این حال، پیشرفت در کشف و توسعه دارو درک محدودی را از پارامترهای محرک RNA توسط مولکول های کوچک نشان می دهد[2]. QSPR روشی مبتنی بر رویکرد مستقل از بهینه‌سازی مولکول براساس توصیفگرهای ساختاری مولکولی و توپولوژیکی است، که به عنوان یک رویکرد جذاب در مدل‌سازی معرفی شده است. از ویژگی های کلیدی آن استفاده از توصیفگرها بر اساس سیستم ورودی خط ورودی مولکولی ساده شده (SMILES) می باشد[3]. در این تحقیق، مجموعه ای از 48 مولکول کوچک متصل به ساختارRNA از مقالات معتبر جمع آوری شد و خواص ترمودینامیکی آنها بر اساس الگوریتم مونت کارلو بهینه سازی گردید. به کمک مجموعه های اعتبار سنجی در نرم افزار کورال قدرت پیش‌بینی مدل‌ها مورد ارزیابی و مدل‌های پیشگو و قابل‌اعتماد گزارش شد. در نهایت با استفاده از مدل حاصل، توصیفگرهای با اهمیت افزاینده و کاهنده ی خواص ترمودینامیکی دراتصال مولکول های کوچک به ساختار RNAپیش بینی،محاسبه و گزارش گردید.